沉香（李铭祖 配音）从小就和父亲刘彦昌（谢添天 配音）过着相依为命的生活，因为没有母亲，沉香常常遭到学校里恶霸的欺辱。某日，刘彦昌终于将妻子的秘密告诉了沉香，原来，沉香的母亲本是天上的三圣公主（丁建华 配音），因为和凡人相恋触犯天条，被二郎神杨戬（王肖兵 配音）压在莲花峰下思过。 带着母亲留给自己的沉香宝带，沉香踏上了寻找母亲的旅途，途中遇见了善良的朝霞姑姑（黄怡晴 配音），知晓了当年杨戬利用宝莲灯陷害母亲的来龙去脉。朝霞姑姑带着沉香面见了霹雳大仙（刘钦 配音），沉香拜其为师磨练武艺，更经受住了霹雳大仙给予的重重考验，最终来到了莲花峰下。
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！
桃夭、柳公子、磨牙、滚滚一行为了寻找失踪的百妖谱，开启了在洛阳城的探险。期间遇到了绛君、咸鼠、佛眼、玄狏、婴源、人渠、狭怪以及智斗大BOSS百妖谱。
