该片是国内首部以“扫黑除恶”行动为题材、展现全国扫黑办督办案件的影视化作品，讲述某扫黑专案组组长宋一锐带领组员由一起征地案深入调查，突破层层阻挠，与幕后的黑恶势力展开激烈斗争，最终揭开腐败官员利用公职权力充当犯罪保护伞的虚伪面具，将犯罪分子绳之以法的故事。
奇艺坊马戏团在马来西亚巡回演出，团员们偶然听说二战时期日本人留下的宝藏的消息。在飞刀高手张大初（邹兆龙 饰）的带领下，他们一行五人杀害寻宝者，一心想成为飞刀行家的小人物桑尼（郭富城 饰）尾随前来，亲眼目睹大初一众行凶全过程。他被迫随众人下洞，却无意开启日军留下的生化武器。经过一番难以想象的艰苦磨难，桑尼侥幸逃生，却变成奇怪的摸样。 与此同时，香港接连发生数起抢劫案。行凶者赤手空拳，手段残忍，他们正是受毒气感染发生变异的张大初等人。这一连串事件震惊全港，警方从内地请来个中高手孙皓（吴京 饰）与程秀华（张静初 饰）协助调查。而桑尼也摇身一变成为与邪恶对抗的正义使者……
一名素描艺术家和一名警察一起利用他的脸的描述来揭开一个难以捉摸的杀手的身份，这刻在残暴犯罪的目击者的记忆中。
王启聪（陈奕迅 饰）和李耀庭（郭富城 饰）是互不认识的重案组探员。聪大大咧咧不修边幅，庭辣手灵敏自命不凡。两个性格各异的警界精英因为一宗案件聚到一起，女警冯宝宝（郑希怡 饰）暂时成为他们的上司。 这宗案件由KEN（黄品源 饰）引发，他和女友打算盗窃一件价值连城的珠宝，还商量到手后就隐退江湖。结果却是螳螂捕蝉黄雀在后，他们盗来的宝物被另一伙人看上，他们追杀并捉走了KEN，女友则带着珠宝幸得逃走。她向警方提出要求：她愿意用这条项链，换回KEN的安全回来。 警方开始追查绑架KEN的黑帮。其间聪、庭和冯宝宝却意见各异冲突不断。案件的侦破困难重重。
一位离群索居的前贩毒集团成员在救下一名歌手免遭杀害后，又卷入了新的血腥冲突之中。与此同时，一位心怀复仇之心的犯罪头目也对他发起了攻击，想要对他进行报复。
一位罗波那后裔因其唯一的摩托车被一位“现代罗波那”夺走用于选举集会，而被卷入冲突。这场起初微不足道的不公，很快便升级为一场为了自尊与尊严而战的激烈斗争。
东北街霸阿能（释彦能 饰）流落至香港，刚偷渡上岸就遭到警察盘查，幸得留学归来的佳慧（虞朗 饰）将其救下。而佳慧的父亲重病过世，其掌管的城寨南区被各方势力虎视眈眈。阿能及时出手护住佳慧，并在阿坤（吕宇 饰）牵线之下结识西区红姐（孙子钧 饰）欲重整城寨秩序。此时盘踞北区多年的神秘恶势力伸出魔爪......
